雅库茨克市与各主要地区之间都有交通联系，有多条航空线路与俄罗斯各地相连。此外还开通了中国牡丹江—雅库茨克国际客运航线、中国黑河—雅库茨克国际货运航线，2004年开通了中国哈尔滨至雅库茨克国际包机航班。