在就藩瀛洲的藩王们挑选领地时，朱媺娖则在召开军务院、内阁联合会议，商讨朝廷开辟瀛洲的政策。

最初，有人提议彷照之前对马六甲的安排，设置都督府，以军事为主，兼顾民生。

但仔细讨论之后，被否决了。

因为瀛洲的情况与马六甲并不相同。

马六甲当初虽然是海外飞地，但其地处东西方海上交通要道，位置十分重要，且商贸繁荣，当地土民也已开化。

如今朝廷更是准备将其纳入南海省，取消都督府，改置府县。

至于瀛洲，离大明更遥远不说，而且地理位置并不怎么重要，又是真正的蛮荒之地，并不需要如都督府一般去精细治理。

须知，越精细的治理，朝廷所花费的成本便越多。

粗放一些，朝廷所花费的成本便少。

最后，经过连续三日的讨论，决定以革新的“卫所制”外加“公司制”来开辟瀛洲。

即朝廷先设立瀛洲都指挥使司，再成立大明瀛洲垦殖公司。

瀛洲都指挥使司简称瀛洲都司，归军务院管辖，属工屯军序列，也即是大明新军第四序列。

从大明工屯军，以及卫戍军、边防军、禁卫军、御林军的适龄退伍兵中招募兵员。

其军饷分为两部分，一为比照工屯军军饷的保底军饷，简称“底饷”。二为垦殖奖金。

底饷依旧由朝廷通过“军务院——军饷司——大明银行”这个途径发放。垦殖奖金则由垦殖公司根据当年的盈利按照一定百分比发放。

瀛洲都司的编制相比以前也大有改变。

都司之下只有卫、所、屯（堡）三级，编制大大缩小。

且都司军官都是由军务院任命的，而非世袭制。

另外不论是军官，还是普通士卒，都可以携带家人前往海外都司。普通士卒退伍后，还可以选择落户当地为移民。

至于军官，也可以落户海外，但不得在任职地落户，只能在其他的卫。防止其依仗权势成为以前那样的毒瘤式卫所军官。

都司设都指挥使一名，级同提督，为正一品武职。

另设都司同知、都司佥事各一名，为从一品文职（军队体系）。

然后就是都司各职能部门的都事、断事、经历等官吏了。

后面的卫、所、屯长官级别就比较低了，分别对应参将、千总、哨正（实称屯正）。

且经过联合会议讨论，其编制变得灵活，实际兵员数目则大大减少。

每屯正兵（工屯兵）50人。

5到10个屯为一所，即每所约有工屯兵250到500人。

至于卫，因地而设，故所辖屯所暂不设下限，上限编制则是工屯兵3000人，既不超过60个屯。

工屯兵的主要任务，便是按照上面安排，到指定地点垦荒种田，建立屯堡。

垦荒种田前期所需的钱粮，则由垦殖公司负责，算是垦殖公司的前期投入。

至于垦殖公司是否会因为这一大项投入而几年内无法盈利，就得看垦殖公司如何经营了。

就一个都司而言，设立或取消一个卫的权利掌握在朝廷手里。但某个卫下开辟多少个屯堡，又在哪里开设，以及什么时候开设，却是由垦殖公司与都司方面协商确立的。

目的就是让垦殖公司控制好投入，以及尽快盈利。

而非是像大明此前开辟疆土那样——完全由朝廷主导，很快就搞成高投入、低收益的局面，最终因为常年亏损巨大，入不敷出，不得不放弃对当地的统治。（比如越南、漠南、漠北。）

大明瀛洲垦殖公司构建，则参考英、荷的东印度公司，以及后世一些组织架构。

初步拟定的结构则比较简单，从上到下依次为公司、商馆、开发区（