缩者，径自诛之，以肃人心。且万人之命，系于一将，若非重以此权，谁肯舍死赴敌。近年以来，朝廷命将制敕，所开止曰军法从事，所以为将者，多避嫌疑，军士虽有退缩，未敢轻诛一人，以致军令不严，往往失机，虽罪坐主将，无益于事。自诏书到日，若官军有不用命退缩者，就阵斩之以徇，妄生讹言、蛊惑人心，情罪至重者，会同审实，亦就斩之。麾下分守、游击等官，有不从命者，以军法治之！”

朱载坖首先加重总兵官的权力，尤其是对于治下参将等的军官的管理权，同时要求按照沿边的实际情况，重新划定分守辖区，同时裁减合并一批分守参将，朱载坖认为分守参将是朝廷配置在边防要地进行专守防卫，加强防御的专官，要有区别的进行设防，要有防御重心，这是最关键的事情。

除此之外，就是对于总兵衙署的指挥体系的建设，原本总兵只是差遣，所以并无衙署，也没有相关的下属，朱载坖之前已经在镇下配置参谋军务、后勤等司，作为总兵衙署的常设机构，协助总兵官管理一镇防务，用来取代这些参随，朱载坖认为要加重这些机构的权力，实现参谋体制的建立。

朱载坖命令取消协守副将，同时以副将专管参谋军务和清军督练等各司，同时将这些机构实施双重管理，即直接接受军机处的监察，同时为总兵官提供幕僚业务，建立从朝廷到各镇以至于各分守区的参谋机关，加强朝廷对于九边的直接控制，在分守参将下已经有参谋处等机构，既受总兵衙门各机关的直接领导，又向参将提供参谋业务。