对于大明来说，现在大明周围的蒙古部落中，土默特部和卫拉特部已经达成了封贡，而土蛮部已经被彻底消灭，鄂尔多斯等部已经被土默特、卫拉特等部予以消化，仅剩在漠北的喀尔喀部对于大明的各种招抚毫无回应，他们对于大明的招抚没有任何回应的原因也是很简单的，因为他们认为大明官军不可能大规模的远出塞外，征讨他们，所以他们对于大明的招抚是完全没有感觉的。

朱载坖之前也曾经通过土默特部招抚喀尔喀部，但是他们都无动于衷，朱载坖现在也没有功夫和他们扯淡，朱载坖现在的主要问题是要解决西域的问题。

之前朱载坖就要求军机处领导参谋军务总署和五军都督府，对于全国的卫所予以调整和重新划设，现在大明的卫所，还是太祖、成祖士气所设立的，二百年过去了，这些卫所的设置已经不是很合理了，这点朱载坖是很清楚的，同时有一些军屯也不够了，所以说五军都督府和参谋军务总署要根据实际情况对于卫所进行重新的规划。

首先就是新增卫所，这点是极为重要的，因为朝廷开疆拓土，扩展了的领土，必须要有人才能够予以实际控制，这点是极为重要的，所以在南方、东北、北方、和西北等新收复的领土，要按照当地的实际情况新设立卫所，加强朝廷对于这些地方的控制，现有的卫所显然是不足的，这点朱载坖是很清楚的。

原本大明内外所谓是三百五十余，但是朱载坖很清楚，现在大明的土地面积激增，原本的三百余卫所显然是不够用的，尤其是在东北和西北，要大量的设立卫所，加强朝廷对于这些地方的控制，经过五军都督府和参谋军务总署的商定之后，这次大明的卫所总数要增加到四百六十余，几乎要增加一百多个卫所，首先要解决的就是兵源问题，朱载坖命令从卫所的军余子弟中招募兵员，同时就是招募无地百姓投军。

卫所相比于普通百姓，最具有优势的两点就是第一现在卫所军士是要给地券的，也就是可以从朝廷获取五十亩的土地，边疆地区还要增加，这份土地，只用缴纳军屯籽粒，也就是相当于地方百姓的田赋，而不要缴纳均徭银，军户没有均徭银，因为他们的户籍是在五军都督府，不受地方官府管理。只有军户的正军要每年在农闲时节参加操练，但是操练的时候是要给予饷银的，一旦被选为脱产军士，就可以免除籽粒，这是朝廷对于士卒的优待。

第二就是军士子弟在卫所可以享受到一些特殊待遇，如卫所士卒子弟可以免费就读卫学，其中成绩出色的可以由卫所向地方推荐参加科举和参考军事学院，这些都是地方百姓所不能比拟的，所以在大明，现在卫所军籍反而又受到重视了，所以朱载坖命令招募军余子弟和民间的无地百姓，充实各个卫所。

同时将大量在镇协官军中年龄较大的下级军官转入卫所之中任职，这些军官们战斗经验还是十分之丰富的，但是由于现在官军主要是从军事学院中毕业培训的军官作为基层军官的主力，这些从士卒中成长起来的军官年龄偏大，对于新武器，新战法的适应能力不足，但是朱载坖认为他们丰富的军事经验仍然是极为重要的，所以要将这些年纪偏大，但是有丰富作战经验的军官们调任卫所，让他们负责组织卫所士卒的训练，加强朝廷的预备役建设。

除了这些事情之外，还有就是对于南方卫所的调整，尤其是东南、两广卫所的调整，这些地方由于地狭人稠，朝廷所直接控制的土地是很有限的，如果朝廷在这些地方还是要坚持每军授田五十亩的话，无疑会极大的激化卫所和地方的矛盾，但是东南乃是财赋重点，南京乃是大明留都，太祖高皇帝陵寝之所在，不能不重，所以朱载坖特地指令对于南方尤其是东南等地的卫所，要采取不同措施。

对于卫所现有的军屯，自然是不能再被侵夺了，这点朱载坖的态度是很坚